研究方向
碩士班四個主要方向為：
建築理論與歷史、地域文化、電腦媒體與新形式、綠色建築。
這四個方向包含之研究課題與專長之教師一覽表如下：
| 建築史 | 吳光庭、米復國、陸金雄、王俊雄 |
| 歷史保存 | 米復國 |
| 住宅研究 | 米復國、蘇睿弼 |
| 都市設計 | 黃瑞茂、劉欣蓉、蘇睿弼、卡馬可 |
| 設計理論、認知科學與人工智慧 | 陳珍誠、鄭晃二 |
| 環境行為 | 劉綺文、康旻杰 |
| 文化地景 | 康旻杰 |
| 電腦輔助建築設計 | 陳珍誠 |
| 環境控制 | 王文安、加藤義夫 |
| 採光遮陽與照明、建築節約能源 | 周家鵬 |
| 建築教育 | 王紀鯤、鄭晃二 |
| 綠建築 | 周家鵬、王文安、加藤義夫 |
| 宗教建築 | 李安瑞 |
| 社區建築 | 黃瑞茂、鄭晃二 |
| 規劃設計 | 鄭晃二、黃瑞茂 |
| 建築師執業環境 | 王紀鯤 |
| 結構力學 | 何德仁 |
| 公共藝術 | 卡馬可 |
碩士班課程改革重點包括下列項目:
（一）形成 1.建築理論與歷史、2.地域文化、3.綠色建築、4.電腦媒體與新形式 等四個特色。目前課程已秉此方向進行分組及課程修訂。
（二）積極形成一個以「亞太地區城市」為主之研究群，內容包括新加坡、香港、上海、雪梨、夏威夷、台北等城巿之研究，研究生可與上述城交流、短期留學等，此方向將成為本系碩士班都巿設計研究之特色。
（三）碩士班之分組將有一組以設計實務為取向，學生修習四個高階設計課程，其作品即可取代論文，此一分組對建築系學生將具極大之吸引力。
目前之建築與都巿設計組即是以訓練進階的設計者為目標組，並提供電腦繪圖的演練機會；須完成三個密集的設計操作，應選修設計研究及電腦設計應用，並提出一篇設計論文。建築與都巿理論組及建築技術組均以論文寫作做為完成學位之條件，應選修研究方法。理論組以訓練學生熟悉各種相關理論與批判能力之培養為目標；技術組則以訓練相關建築技術之掌握及綠色概念之思考為目標。
遠見雜誌於1999年首度進行全國建築設計學系學術聲望評鑑，本系榮獲建築設計類全國第二名，在課程規劃前瞻性、教學品質、社會人文關懷、基礎訓練項目名列各校第一，理論與實務結合、師資陣容、學術研究能力名列第二。